Bütün canlılar yaşamları boyunca çeşitli enfeksiyonlara yakalanarak hasta olabilirler. Yavru köpekler, annelerinden aldıkları antikorların etkisi sona erdiğinde enfeksiyonlara karşı savunmasız hale gelirler.

Köpeklerin üretim yerleri, pansiyonlar, barınaklar, köpek gösterileri ve pet shoplar gibi kalabalık alanlarda bulunan yavru köpekler daha fazla risk altındadır. Bu sebepten dolayı, bakteriyel ve viral aşıları tam olarak yapılmamış köpekler tehlike altındadır. Köpek hastalıklarının birçok çeşidi bulunmaktadır.

Viral hastalıklar hem bulaşıcıdır hem de virüsten kaynaklanır. Bu hastalıkların en önemli farkı, hücre içinde aktif oldukları için antibiyotiklerle yok edilememeleridir. Antibiyotikler bu mikroorganizmalara etki edemez. Bu nedenle viral hastalıklara karşı önlem aşılanma ile alınmaktadır.

Kuduz virüsü sıcak kanlı hayvanların, özellikle merkezi sinir sistemlerine etki eder. Bu hastalığın tedavisi bulunmamaktadır ve ölümcül bir hastalıktır. Kuduzdan korunmanın tek yolu aşılanmaktır. Kuduz, sadece köpek hastalıklarından biri değildir; diğer tüm memeli canlılara ve insanlara da bulaşabilen ölümcül bir hastalıktır. Köpeklerin aşılanması, 12 haftalık olduktan itibaren her yıl yaptırılmalıdır. Sahipli köpeklere bu aşının yaptırılması kanunen zorunludur.

Distemper hastalığının etkeni virüstür. Çoğunlukla solunum yolu ile bulaşır ve ölümcül bir hastalıktır. Bu hastalıktan köpekleri koruyabilmek için 45 günlükten itibaren aşılara başlanması gereklidir. Özellikle 16 haftalık olmuş yavrular büyük risk altındadır. Eğer yavrular anne sütünü yeterli olarak almamış ise bu rahatsızlık daha erken görülebilir. Yetişkin köpeklerde ise aşılar her yıl uygulanmalıdır.

Leptospirosis, köpeklerde böbrek fonksiyonlarını etkileyen bir hastalıktır. Ayrıca ateşlenmeye neden olur. Vücutta bulunan üreyi böbrekler süzemeyerek dışarı atmada sorun yaşar. Bulaşma yolu genellikle idrar yolu ile olmaktadır. Bu rahatsızlık insanlara da bulaşabilmektedir.

Brucellosis virüsü genital organlara yerleşir. Bu virüs hamile köpeklerde düşük ve kısırlığa sebep olabilir. Bu rahatsızlık insanlara da bulaşabilmektedir.